A Auditoria Interna do TJMG tem por finalidade planejar, coordenar e executar as funções de auditoria interna, com atuação através do desempenho da Auditoria de Conformidade (ou de Legalidade) e da Auditoria de Gestão (ou Operacional, como é considerada no Tribunal de Contas da União).

No desempenho da Auditoria de Gestão, a Audit preocupa-se em acompanhar e examinar, com base no planejamento de gestão institucional apresentado, a regularidade dos atos da gestão administrativa, verificando sua efetividade e eficiência, frente aos resultados alcançados, bem como em apresentar subsídios para o aperfeiçoamento dos procedimentos administrativos e dos controles internos das áreas responsáveis.

No desempenho da Auditoria de Conformidade, a Audit cuida de verificar a regularidade, legalidade e eficácia dos atos das gestões contábil, orçamentária, financeira e patrimonial, com foco nas áreas responsáveis por recursos humanos, procedimentos licitatórios, dispensas e inexigibilidades de licitação, contratos e convênios em geral, sistemas informatizados e de informações, obras, recursos financeiros, concessões de diárias de viagens e de regime de adiantamentos, conciliações bancária e patrimonial e demais atos que demandem dispêndios financeiros e orçamentários.